Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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