Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms