Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E4f1Q8CCE9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms