Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Defa22Q8C1N8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms