Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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