Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms