Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms