Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Smim19Q80ZU4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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