Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms