Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2eQ80UW8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms