Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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