Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM6

Fsd1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsd1Q7TPM6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fsd1Q7TPM6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms