Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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