Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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