Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms