Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Timd4Q6U7R4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms