Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfrkbQ6PIJ4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms