Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrimpolQ6P1E7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms