Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tpm4Q6IRU2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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