Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms