Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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