Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbccd1Q640P7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbccd1Q640P7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbccd1Q640P7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbccd1Q640P7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbccd1Q640P7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tbccd1Q640P7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tbccd1Q640P7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tbccd1Q640P7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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