Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PatjQ63ZW7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms