Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms