Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Kdm5dQ62240 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5dQ62240 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms