Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms