Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms