Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms