Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a3Q5XF89 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms