Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spsb3Q571F5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms