Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms