Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms