Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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