Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms