Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp3Q3ULW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms