Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms