Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf149Q3U2C5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf149Q3U2C5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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