Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms