Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms