Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms