Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Shroom4Q1W617 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shroom4Q1W617 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Shroom4Q1W617 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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