Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms