Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms