Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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