Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc39dQ0VF76 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39dQ0VF76 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39dQ0VF76 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39dQ0VF76 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttc39dQ0VF76 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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