Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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