Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms