Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms