Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms