Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms